酮康唑抑制真菌麥角甾醇生物合成並改變細胞膜其他脂類化合物的組成，實現抗真菌的目的。因此，酮康唑片適用於全身真菌感染，如全身念珠菌病、副球孢子菌病、組織胞漿菌病。以及治療皮膚癬菌和(或)酵母菌引起的皮膚、毛發和粘膜感染由於其感染部位面積及深度等因素導致局部治療無效時，方可用酮康唑片治療。
伊曲康唑膠囊是壹種合成的廣譜抗真菌藥，適於治療外陰陰道念珠菌病，花斑癬、皮膚真菌病、真菌性角膜炎和口腔念珠菌病等。伊曲康唑為口服廣譜抗真菌制劑, 已廣泛應用於臨床治療淺部真菌病和甲真菌病。
通過上面的介紹，我們能夠知道酮康唑片和伊曲康唑膠囊的功能主治是有區別的。另外酮康唑，是咪唑類，它對於念珠菌病、各種深部真菌病和皮膚癬菌病有效，但酮康唑起效慢、生物利用度不定，以及對類固醇合成的副作用，限制了其在嚴重重癥真菌病方面的應用，而伊曲康唑，為三唑類藥物，與酮康唑相似，但抗菌譜更為廣泛，副作用更少，除了念珠菌感染、孢子絲菌病、組織胞漿菌病、皮膚癬菌病和足分支菌病以外，它還可以治療曲黴病，隱球菌病也可用伊曲康唑治療。