醫院始建於1945年10月，2012年12月成為上海交通大學附屬第六人民醫院南院。 2012年12月通過上海市醫院綜合評價（評審）中心的三級醫院評審。
2012年10月整體遷入南橋新城中心南奉公路6600號，占地面積182畝，建築面積9.6萬平方米。
先後成為上海交通大學醫學院教學醫院、同濟大學和蘇州大學教學醫院，南方醫科大學、安徽理工大學（非直屬）附屬醫院，安徽理工大學臨床醫學院，是南昌大學等10余所醫學院校的教學基地，上海市住院醫師規範化培訓基地、上海市護理學會急診急救護士實訓基地；擁有市級中心實驗室和國家藥物臨床試驗基地；建成碩博士點20個，已招收研究生38人，畢業6人；獲國家自然科學基金項目1項，省部級科研項目8項，市局級科研項目29項，區級科研項目46項；國家、市級繼續教育項目33項；發表SCI論文40篇；獲市醫學科技三等獎3項；獲國家實用新型專利32項。