如果結石造成明顯梗阻，特別是膽總管結石，還有可能出現急性梗阻性化膿性膽管炎，這是壹種非常嚴重的急腹癥，如果不及時進行手術或者介入減壓治療，患者很有可能出現休克，最終導致死亡。
另外，肝內膽管結石如果反復發作，還有可能造成膽管狹窄、肝臟萎縮，甚至引起膽管細胞癌，不僅嚴重影響患者生存質量，還會影響患者生存期。
而肝外膽管結石，特別是膽總管下段小結石更容易造成胰腺炎，如果出現胰腺出血、壞死，是壹種非常嚴重的疾病，不僅可以造成腹腔內大出血、腸瘺等局部並發癥的發生，還可以造成多器官功能衰竭等全身並發癥，最終導致死亡。
而且這種疾病花費非常昂貴，死亡率也非常高。