1、地點：哈爾濱醫科大學總部位於黑龍江省會哈爾濱，而大慶校區位於黑龍江的地級市大慶，總部所在地哈爾濱作為大城市，提供更多的就業機會。
2、教師：學校總部擁有全國名師和省級名師，而大慶校區則有617名全職和兼職教師，其中包括2名龍江學者，以及53名博士生導師和碩士生導師，總部在師資力量上更為雄厚。
3、專業數量：大慶校區設有12個本科專業，包括醫學檢驗技術和護理專業等省級重點專業，而總部則擁有更多國家和省級壹級本科專業，專業設置更為豐富。