藿香正氣水和小柴胡的適應癥是不壹樣的，小柴胡是用於解表散熱，疏肝和胃。用於外感病，邪犯少陽證，癥見寒熱往來、胸脅苦滿、食欲不振、心煩喜嘔、口苦咽幹。
藿香正氣水解表化濕，理氣和中。用於外感風寒、內傷濕滯或夏傷暑濕所致的感冒，癥見頭痛昏重、胸膈痞悶、脘腹脹痛、嘔吐泄瀉；胃腸型感冒見上述證候者。
壹般根據自身癥狀選擇壹種就可以了。如果真要兩種都用，服藥的時候兩者錯開壹個時間差，比如說吃過壹個後另壹個過半個多小時或壹個小時再用。
擴展資料
1、藿香正氣水作用：
解表化濕，理氣和中。用於外感風寒、內傷濕滯或夏傷暑濕所致的感冒，癥見頭痛昏重、胸膈痞悶、脘腹脹痛、嘔吐泄瀉；胃腸型感冒見上述證候者。
2、小柴胡作用：
和解少陽：柴胡苦涼，入少陽經，少陽受邪，邪並於陰則寒，邪並於陽則熱，柴胡為少陽專藥，氣質輕清，苦味最薄，透泄半表半裏之外邪，使從外解，故有和解少陽之功效。
人民網―藿香正氣水有哪些功效?