1. 根癌農桿菌對植物細胞的識別和附著。
2. 根癌農桿菌對植物信號物質的感受。
3. 根癌農桿菌Ti質粒上的vir基因以及染色體上操縱子的活化。
4. T-DNA復合體的產生。
5. T-DNA復合體的轉運。
6. T-DNA整合到植物基因組中。
在這些步驟中，Ti質粒上的T-DNA（可轉移的DNA）是主要負責將新的遺傳信息傳遞到植物細胞中的關鍵部分。