引物設計為什麽不能連著幾個壹樣的

盡量不要4個連續堿基相同，這樣很容易形成引物二聚體，會影響pcr效率。GC控制退火溫度的能力比AT強很多，所以如果有三個G或者三個C，他們就有能在模板上對應的位置退火上去的可能，形成Taq酶的結合構象，從而擴增，因為5端不需要特異性結合照樣能擴增。

其3′端不應超過3個連續的G或C,如GGG或CCC,因這樣會使引物在GC富集序列區錯誤引發。引物3’端的末位堿基對Taq酶的DNA合成效率有較大的影響。