黃曲黴菌（學名：Aspergillus flavus）或稱為黃曲菌、黃曲黴、黃曲黴與黃曲黴等，是壹種真菌。在自然環境中，它是壹種常見的黴菌，在儲存的榖類中會造成儲存的問題。它也是壹種人類的病原，會造成肺的曲菌癥（Aspergillosis），有時候也會引起角膜、耳與鼻眼框的感染。許多菌種會產生足量的黃曲黴毒素，這是壹種有致癌性且有劇烈毒性的化合物。黃曲黴菌的孢子是壹種過敏原（Allergen）。黃曲黴菌有時候也會造成蠶孵卵所的損害。如花生、玉米易汙染黃曲黴及其毒素，小麥、玉米易汙染鐮刀菌及其毒素，大米易汙染青黴及毒素。
常見的黴菌毒素有黃曲黴毒素、赭曲黴毒素、鐮刀菌毒素和青黴菌毒素等。
黃曲黴菌存在於黴變的花生、谷物、果仁和大米上。肝癌與黃曲黴菌含量高有直接關系。為了防止產生黃曲黴菌，最好將桃仁、果仁、谷物貯藏在密封和幹燥的地方，不要吃發黴的食品，尤其是發黴的幹果、桃仁和糧食。
主要由黃曲黴菌和寄生曲黴產生，其基本結構中都含有二呋喃環和雙香豆素，黃曲黴毒素主要損害肝臟，表現為脂肪變性、出血、壞死及膽管上皮、纖維組織增生。同時腎臟也可受損害。
它形成在食物上，很難殺死
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