學院重視科研平臺和研究基地建設，學院聯合其他優秀的藥學研究力量成功申報國家科技重大專項計劃——重大新藥創制項目，組建起“國家綜合性新藥研究開發技術大平臺——山東省重大新藥創制中心”。該中心作為集產、學、研於壹體的創新藥物研究機構，是國家重點支持建設的15個國家級創新藥物研究基地之壹，為山東和全國的藥物創新研究提供技術支撐。同時，學院還與多家大型制藥企業在校內聯合建立了新藥研究中心或實驗室，如與魯南制藥集團合建的“山東大學-魯南天然藥物研究院”、與瑞陽制藥集團合建的“山東大學-瑞陽新藥研究基地”、與齊都藥業有限公司合建的“山東大學—齊都創新藥物研發中心”等。這些不僅為新藥研發工作提供了先進的技術平臺，而且極大促進了研究型教學水平的提升和科研成果的直接轉化。