市衛生局機關行政編制為33名。其中，局長1名，副局長3名；正科級領導職數14名（含直屬單位黨委專職副書記1名、離退休幹部工作科科長1名、市新型農村合作醫療協調領導小組辦公室主任1名），副科級領導職數3名。
中***濮陽市紀律檢查委員會、濮陽市監察局派駐市衛生局紀律檢查組、監察室（紀檢組、監察室合署辦公），行政編制2名，其中：紀檢組長1名，紀檢副組長（監察室主任）1名。根據工作需要，可配備兼職紀檢監察工作人員。
核定機關駕駛員事業編制3名，經費實行全額預算管理。