有機水果完全不用化學肥料、農藥、生長調節劑、蓄禽飼料添加劑等合成物質，也不使用基因工程生物及其產物。綠色分兩種，A級和AA級。前者允許限量使用化學合成生產資料，後者則較為嚴格地要求在生產過程中不使用化學合成的肥料、農藥、獸藥、飼料添加劑、食品添加劑和其他有害於環境和健康的物質。AA級綠色水果基本等同於有機水果。有機水果比綠色水果難得。
有機水果在可能的範圍內，盡量依靠輪作、作物稭桿、家畜糞尿、綠肥、外來的有機廢棄物、機械中耕、含有無機養分的礦石及生物防治等方法，保持土壤的肥力和易耕性，供給作物養分，防治病蟲雜草危害。