但是任何藥物都有其副作用，相對於其他治療精神病的藥物來說，奧氮平的副作用應該算是比較少的，其常見不良反應如下：
臨床試驗中與奧氮平使用有關的唯壹不良反應是嗜睡和體重增加，34%服用奧氮平的患者血漿催乳素濃度有壹過性的輕度升高(末點均數不超過正常值上限，與安慰劑無統計差異)，相關臨床表現(例如：男性乳房增大)罕見，絕大多數患者的激素水平無需停藥即可回復至正常範圍。
臨床試驗中偶見不良反應(1-10%)，包括頭暈、靜坐不能、食欲增強、外周水腫、直立性低血壓、口幹及便秘。偶見肝臟轉氨酶ALT SGPT和AST SGOT無癥狀的壹過性升高。
禁忌癥 奧氮平禁用已知對該藥中任意壹種成分過敏的患者。
註意事項 用藥特殊註意事項
註意：
神經阻滯劑惡性綜合癥(NMS)：臨床試驗中未見有奧氮平所致的NMS報道。但NMS是壹種潛在的致命綜合癥，在其它抗精神病藥使用中已有報道，NMS的臨床表現有高熱、肌強直、精神狀態改變及自主神經紊亂(脈搏和血壓不規則、心動過速、大汗淋漓及心律不齊)，其它體征可有肌酐磷酸激酶升高、肌血紅蛋白尿、(橫紋肌溶解)及急性腎功能衰竭。患者如出現NMS的臨床表現，或僅有高熱而無NMS的臨床表現，均應停用所有抗精神病藥，包括奧氮平。
遲發性運動障礙：與氟哌啶醇比較研究6周以上，奧氮平所致包性運動障礙發生率較低，具有統計顯著性。但長期使用抗精神病藥，遲發性運動障礙風險增加，如果患者出現遲發性運動障礙的體或癥狀，應減藥或停藥，上述癥狀可在停藥時惡化，甚至在停藥後出現。
註意事項：
肝功能指標：偶可出現肝臟轉氨酶ALT、AST不伴癥狀的壹過性升高，多見於用藥初期，有ALT 和/或AST升高、肝臟損害體征和癥狀、用藥前已有與肝功能儲備受限有關疾病以及使用具有潛在肝臟毒性藥物的患者，應加以觀察。治療中如出現ALT/或AST升高，應考慮隨訪和減藥。
癲癇：與其它抗精神病藥類似，奧氮平慎用於癲癇史或有癲癇相關疾病的患者。
血液學指標：與其它抗精神病藥類似，奧氮平慎用於有下列情況的患者：
任何原因所致的白細胞和/或中性粒細胞降低；
藥物所致骨髓抑制/毒性反應史；
伴發疾病，放療或化療所致的骨髓抑制
酸性細胞過多性疾病，或骨髓及外骨髓增殖性疾病。
臨床實驗發現，許多氯氮平所致粒細胞減少癥或粒細胞缺乏癥病使的患者使用氯氮平後未見復發。
抗膽堿能活性：臨床實驗表明，抗膽堿能作用發生率較低，但患者有合並癥時服用奧氮平的資料有限，建議在合並前列腺增生、麻痹性腸梗阻，窄角性青光眼或相關疾病史慎用。