鹹鴨蛋雖然不易腐壞，但壹煮熟就不容易保存了。貯存時要註意防止蛋內失水，鹹鴨蛋壹旦失水，就會導致蛋白發黑，鹹度會增加。對用不同的腌制方法加工的鹹鴨蛋，應采取不同的方法保存。具體方法如下：
1.食材冰箱，鹽水罐
步驟/方法
如果是夏天比較熱的時候，可以放進冰箱冷藏室裏存放，註意不要冷凍，凍過的鴨蛋很不好吃。壹般放在冰箱上層冷藏室就行了。
2.如果在冬天比較冷時，可以把熟鴨蛋放在幹燥通風的地方即可。註意不要放在太陽暴曬處，選擇陰涼的地方最好。比如廚房儲藏櫃頂部，樓梯下面等等。
3.對於用鹽水腌制的鹹蛋，煮熟前不宜長期浸泡在腌制罐裏，把生鹹蛋拿出煮熟並晾幹後可以再放回到鹽水裏，隨吃隨取，這樣既能保證熟鹹蛋長時間放置不變質，也不會讓鴨蛋越放越鹹。
4.如果是包泥腌制的鹹蛋，應保持泥皮濕潤，可定期用濕布給鴨蛋保濕，並置於陰涼處，這樣能保證鴨蛋半年不壞。
5.可以把熟鴨蛋做真空處理，能保證鴨蛋放比較長的時間。這需要專門的儀器，如果鴨蛋比較多可去附近加工廠做真空處理。
註意事項
熟鹹鴨蛋還是盡早吃為好，放時間越長越不好。