核心理論不同：臨床醫學主要以疾病為主，關註疾病的診斷、治療和預防。康復醫學則以殘疾和功能障礙為主，致力於通過非藥物治療手段改善患者的健康狀況。
學科交叉不同：臨床醫學主要涵蓋病理學、生理學、藥理學等基礎醫學領域，而康復醫學則涉及運動學、心理學、社會學等多個學科，更註重患者的全面康復。