1、作用時間不同
長效生長激素的作用時間壹般為1-2周，短效生長激素的作用時間壹般為1-2個月。
2、作用效果不同
短效生長激素的作用效果壹般比較強，能夠起到促進骨骼生長、促進新陳代謝、增加身體靈活性等作用，常用於治療因生長激素缺乏導致的身材矮小、生長緩慢等癥狀。長效生長激素的作用效果壹般比較弱，通常用於治療因生長激素缺乏導致的身材矮小、生長緩慢等癥狀。
3、適用人群不同
由於長效生長激素的作用效果比較強，如果患者存在缺乏生長激素的情況，可以在醫生指導下使用長效生長激素進行治療，從而促進骨骼的生長，也可以促進新陳代謝，在壹定程度上還可以增強機體免疫力。如果患者存在生長激素缺乏的情況，則可以遵醫囑使用短效生長激素進行治療。
4、副作用不同
長效生長激素的副作用壹般比較小，但如果患者長期使用，可能會導致註射部位出現紅腫、疼痛等不良反應。而短效生長激素的副作用壹般比較大，如果患者長期使用，可能會導致註射部位出現硬塊、皮膚增厚等癥狀。
5、其他
此外，需要註意的是，無論是長效生長激素還是短效生長激素，在使用時都需要在醫生的指導下進行，患者不可以自行盲目使用，以免出現嚴重的藥物不良反應，導致病情加重。