三叉神經疼痛多沿神經分支的分布，如第壹支的疼痛的部位往往在眼的表淺或深處、上瞼及前額。第二支疼痛部位在頰部、上唇和齒齦，而硬腭疼痛者不常見。第三支的疼痛部位在下唇、齒齦，涉及舌部者較少。疼痛的擴散不呈跳躍式，如第三支痛不會越過第二支而到第壹支痛。疼痛亦不越過中線，即使雙側患者，壹側發作時也不越過對側。第二和第三支的疼痛可沿其分支向顳部，比較有規律性。疼痛也可較長時間局限於壹支分布區域。
疼痛可局限於壹支的分布區域內，或僅限於壹支的部分分布區域內。也可同時侵犯二支，但三支同時受侵犯者不多。少數可為雙側。但也不是同時發病，往往壹側首先發病，經過壹時期後，另壹側才出現癥狀，即使雙側同時發病也各有其發作周期，或壹側疼痛較為嚴重，壹側交的疼痛的部位往往在眼的表淺或深處、上瞼及前額。
三叉神經根據病因又可分為原發性三叉神經痛和繼發性三叉神經痛。原發性三叉神經痛：這種三叉神經痛是由於血管壓迫神經造成；繼發性三叉神經痛：這種三叉神經痛的分類是指由於腫瘤壓迫、炎癥、血管畸形引起的三叉神經痛。此型有別於原發性的特點，疼痛常呈持續性，並可查出三叉神經鄰近結構的病變體征。
知此知彼才能百戰百勝，只有了解了三叉神經痛的發病部位才能更準確的診斷治療三叉神經痛。