自古以來民間就流傳著壁虎的尿液毒性很大，使其眼瞎耳聾的說法。如果它滴在人身上會引起潰爛，如果妳吃了壁虎爬上來的東西就會中毒而死。所以在古代被列為蠍子、蛇、蜈蚣、壁虎、蟾蜍“五毒”之壹。如果壁虎尿液接觸到皮膚，應立即清洗幹凈，否則被皮膚吸收後，皮下組織會充血、水腫、出血、壞死、肌肉中性粒細胞浸潤。嚴重時會損害腦軸神經系統，引起脊髓嚴重不良變化，呼吸麻痹，最後導致呼吸衰竭而死亡。抓的時候不要大意。
事實上，壁虎是壹種爬行動物。除了部分物種有毒外，大部分都是無毒的。近年來出現了從鮮蛤蚧中提取的抗腫瘤口服液、中藥配方、中成藥的研發。
古代草藥雖有記載壁虎性味鹹寒，毒性不大，現代書籍文獻多延續古代草藥，但毒性報道甚少，僅有含壁虎的復方“烏龍散”致過敏性肺泡炎的報道。有專家認為可能是壁虎的異性動物蛋白作為抗原引起的，也可能是藥物和蛋白質壹起觸發過敏反應抗原刺激宿主免疫系統引起的。也有壁虎尿致死的報道。所以壁虎雖然含有類似馬蜂的有毒物質，但是毒性很小。