古人對香的使用價值的認識，最初是用來入藥治病的。在中醫中，這種瑞香樹的分泌物被稱為“沈香”，加工後用作藥物，主要用於治療寒凝，嘔吐，呼吸逆轉，大腸便秘，尿淋。有雲:“隋禪師醫術高明，配制五種香料，飲之以濟人。沈香飲、檀香飲、丁香飲、紫莖澤蘭飲、甘松飲，都是以香為主，更多的是不同的藥物，以味解渴，利民。”(引用李時珍《本草綱目》)
沈香所產的沈香具有很高的藥用價值，是我國歷史悠久的珍貴中藥。具有行氣止痛、溫嘔平喘等功效。對腹脹、胃寒、腎虛、哮喘有明顯療效。常用於治療氣逆胸滿、急性心絞痛、腫塊積聚、胃寒嘔吐、霍亂、男寒、口臭瘡毒等。現代臨床試驗表明，沈香是胃癌的特效藥和良好的止痛劑。自古以來，沈香通常被加工成中藥飲片，如沈香粉、沈香片、沈香曲等。