生長部位不同：栝樓，屬葫蘆科，是多年生攀緣草質藤本植物。而瓜蔞為栝樓的果實，秋末果實變為淡黃時采收，懸掛通風處陰幹。
藥效不同：栝樓有很高的藥用價值，它的果實、果皮和種子為傳統的中藥“天花粉、栝樓、栝樓皮和栝樓子”，它的根有清熱生津、解毒消腫功效，而且根中天花粉蛋白有引產作用，是良好的避孕藥。果實、種子和果皮具有清熱化痰、潤肺止咳、滑腸功效。同時由於栝樓的外形奇特，色彩艷麗，可用於園林垂直綠化和室內觀賞。瓜蔞，功能主治為：清熱滌痰，寬胸散結，潤腸。用於肺熱咳嗽，痰濁黃稠，胸痹心痛，乳癰、肺癰、腸癰腫痛。