病原為真菌中壹種半知菌，分慢性發病和急性發病兩種類型。慢性型，5月中，下旬開始發病。發病初期下部須根或側根出現暗紫色病斑，然後變黑腐爛。病害擴展到主根後，自下而上逐漸腐爛。剩下沒爛部分多為“半截參”，接近腐爛部位呈黑褐色，地上部莖葉逐漸變黃，以致枯死。急性型，多在6月中、下旬開始發病，參根壹經感染，整個參根幾乎同時發病，呈水漬狀，質地變軟，維管束變為淺褐色，幾天後全參軟腐。腐爛後的部位，可見少量灰白色的黴狀物。
防治措施：實行輪作，忌重茬；播種前認真選種，剔除病種，進行種子消毒，用健壯無病蟲害的黨參植株作移栽種苗；多雨季節作好排水防澇工作；發病期用50%二硝散200倍液噴灑，或用50%退菌特可濕性粉劑1500倍液澆灌。