中醫認為人是壹個統壹的整體，局部器官疾病與氣血失調、臟腑功能失調有關。因此，卵巢囊腫的治療可以通過疏肝、補腎、健脾、益氣、滋陰養血等辨證方法來實現。
食療
1，飲食宜清淡，不宜吃羊肉、蝦、蟹、鱔魚、鹹魚、黑魚等。
2.避免辣椒、胡椒、生蔥、生蒜、白酒等刺激性食物和飲料。
3、禁食桂圓、紅棗、阿膠、蜂王漿等熱、凝及含激素的食物。
4.多吃瘦肉、雞肉、雞蛋、鵪鶉蛋、草魚、甲魚、白魚、白菜、蘆筍、芹菜、菠菜、黃瓜、冬瓜、香菇、豆腐、水果。
外科療法
主要是手術切除。如果確定囊腫是惡性的，應盡早手術治療，同時配合放療和抗癌藥治療。晚期卵巢癌也應在化療前盡可能手術切除，部分患者仍有治愈希望；那些被確認為新生物的應盡快手術切除。
在手術治療中，不同的患者可能會根據患者的情況切除其輸卵管、附件甚至整個子宮；術後極易出現疼痛、腹水、腸道或輸尿管梗阻、感染等並發癥，對患者術後康復和心理健康造成不利影響。而且傳統的手術治療是從腹部開口，對身體是壹種損傷，恢復慢，容易感染。手術治療的弊端不容忽視。