1、制作方法不同：龜甲是壹種中藥，表面呈黃棕色或棕褐色，部分光滑，部分有疣狀突起，醋龜甲是以龜甲、醋為主要原料，加工炮制後得到的中藥材。
2、功效不同：龜甲具有滋陰潛陽、退熱除蒸、軟堅散結的作用，醋龜甲具有收斂以及軟堅散結的作用。