1、品種不同：
肉松茸是肉蓯蓉，是名貴的中藥材，素有“沙漠人參”之美譽，具有極高的藥用價值。
松茸是天然藥用菌，是食物。
2、產地不同：
肉蓯蓉主產於新疆、內蒙古阿拉善盟，甘肅、寧夏也有分布。
松茸產於四川、西藏、雲南等青藏高原壹帶。
3、生長環境不同：
肉蓯蓉壹般生長在沙地或半固定沙丘、湖盆低地等。土壤以灰棕漠土、棕漠土為主。生長地區氣候幹旱，降雨少蒸發大，日照長，晝夜溫差大。寄生在沙漠樹木梭梭根部的寄生植物，從梭梭寄主中吸取養分及水分。
松茸松茸對生長環境的要求極其嚴苛，只能生長在沒有任何汙染和人為幹預的原始森林之中，通常長在赤松、偃松和鐵杉等樹旁，而且與松茸***生的樹種年齡必須在50年以上。
另外，壹朵松茸長成需要5-6年的時間，生長過程十分緩慢，而且近年來環境的惡化加上大規模掠奪式的采集，野生松茸的生長更是艱難。
參考資料：
百度百科-松茸
百度百科-肉蓯蓉