1、香氣不同：藥芹的香味比較濃烈，可以被用來作為香料使用，而芹菜的香味比較清新。
2、外觀不同：藥芹整體顏色偏深，壹般是綠色，而且葉子比較粗壯，尤其是葉柄，而芹菜的莖部上端與葉子顏色呈現鮮艷清爽的淡綠色，莖部下端是偏白色，葉子則相對細長。
3、藥用性質不同：藥芹是壹種常見中藥，具有範圍廣泛、療效顯著、副作用小等特點，常用於治療咳嗽、氣喘、消炎和消腫等癥狀。而芹菜是壹種食用蔬菜，不具備明顯的藥用價值，只有輕微的利尿、通便和鎮靜等功效。