為了保證藥膳的療效，還需要對藥材和食物進行加工。有的需要切片、切絲、切塊或切段，有的需要粉碎成細粉，有的需要按照中藥炮制的要求進行炮制。如山楂，煎成焦山楂，可健脾助消化；炒山楂炭可以止瀉。有些藥材必須經過炮制以降低其毒性或副作用，如附子和姜半夏。
烹飪技術
壹般沒有難聞氣味的中藥、中藥，可以和食物壹起煮(或磨成細粉)。如果藥物多或者有明顯的難聞氣味，可以將藥物用紗布包好，與食物壹起煮，藥物的性質就會進入食物或湯裏。服用時去除殘渣。也可以先將中藥煎煮，將煎煮液過濾，去渣，再將煎煮液加入到食物烹飪過程中壹起烹飪。為了減少營養成分和有效成分的破壞，藥膳的烹調多采用蒸、燉、煮或煲湯，煎、烤用得較少。