在平行分組設計研究中，將入選患者隨機分為兩個或兩個以上的治療組，每組給予不同的治療。這些治療包括壹個或多個劑量的藥物、壹個或多個對照，例如安慰劑和/或陽性對照。最常見的平行對照試驗是試驗藥物A和對照藥物B之間的比較..平行對照設計的缺點是兩組患者可能存在不平衡的相關因素，需要的樣本量較大，是交叉設計的兩倍。在交叉對照設計中，每個患者應服用兩種藥物:試驗藥物A和對照藥物B，並且壹種藥物應在另壹種藥物之前使用。給藥順序是隨機的，以避免總是先用好藥或差藥而造成的偏差。交叉對照的第壹個好處是可以做自我比較，所以可以消除個體差異對結果的影響；第二個好處是可以減少患者數量。但其缺點是受試者的參與時間相應延長，會影響受試者的依從性，失訪和早期脫落相對較多。
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