(2)註射激素轉移因子。西醫主要通過註射轉移因子等激素，提高人體免疫功能來治療扁平疣。因為這種間接治療不能直接殺死扁平疣病毒，所以治愈率也很低，尤其是對壹些老年人。
(3)采用激光根除的方法。因為扁平疣病毒在表皮下，激光只能根除表面的扁平疣顆粒，皮下的病毒沒有根除，無法起到根本的治療作用。就算當時根除了，扁平疣也往往會在幾個月後重新出現。