懷孕初期也就是懷孕前三個月，在此期間是不建議聞艾灸的，因為艾灸具有活血化瘀，促進血液循環的作用，而懷孕初期是胚胎發育的關鍵期，胎兒還沒有發育穩定，如果接觸艾灸，就可能會導致先兆流產，對孕婦以及胎兒的危害都是很大的，平時要定期做好產檢，以便於及時發現問題，並且在懷孕初期也不要進行性生活。
艾草是壹種抗菌抗病毒的藥物，因為艾草對病菌有著抑制和殺傷的作用，而且對呼吸系統疾病也有著防治的的作用。所以孕早期是可以聞艾草的芳香味道的。但是不能接觸有害物質以及放射性物質。
艾煙對孕婦沒有壞處，還可以起到安胎的作用，艾煙還能凈化空氣，起到殺菌抑菌的作用，通過科學實驗證明，艾煙對肺炎球菌、流感桿菌、大腸桿菌、結核桿菌等均有殺滅和抑制的作用。艾葉燃燒後的煙能殺滅空氣重的細菌率高達70%。因此，孕婦聞艾灸是沒有影響的。
現在有很多懷孕後。懷孕後由於孕酮低，有很多懷孕後處於胎停育的狀態。