日本漢方藥與中藥應屬於同根同源。漢方藥在秦漢時期傳入日本。明治維新後，日本全面引進西方醫學體系，從根本上排斥漢方醫學，導致其幾乎滅絕。上世紀70年代以來，以老年疾病為主的疑難病癥越來越多，西醫對此束手無策，且西藥對人體副作用大，價格昂貴，因而漢方醫藥又逐漸興起。1976年，日本厚生勞動省確定了漢方藥醫療保險適用制度，即批準可以使用中國《傷寒雜病論》中的210個古方漢方生產漢方藥，漢方藥產業隨之得到迅猛發展。
根據日本社會調查研究所的統計資料，壹般用漢方制劑的生產廠家數由1996年的92家增加到1999年的111家，種類也從1996年的2154種增加到1999年的2812種。漢方藥開始被廣泛應用於老年疾病及慢性病治療，承認漢方藥療效的醫師也逐漸增多，目前使用漢方藥的醫師已占72%，而其中又有70%的醫師用藥時間達10年之久。