懷孕期間必須慎用或減量使用的中草藥包括：桃仁、蒲黃、江花、歸尾、枳實、厚樸、郁金、川椒、檳榔、滑石、木通等。這些藥物對胎兒腦及肢體的生長發育有抑制作用，因此在懷孕期間不要單獨使用，最好不用。
妊娠期間盡可能避免使用或視病情需要減量使用（減輕藥物副作用）的中草藥包括：附子、生大黃、芒硝、烏頭、甘遂、三棱、生南星、生五靈脂、穿山甲、皂角刺、硼砂、雄黃、射幹及馬鞭草等。
孕婦禁止使用的藥物包括：巴豆、大戟、牽牛子、鉛粉、麝香、蜈蚣、商陸及士牛膝等。經動物實驗表明，孕婦使用可導致死胎、流產、先天畸形等，因此懷孕期間應絕對禁止使用。