國家執業藥師資格考試由人事部和國家美國食品藥品監督管理局聯合舉辦。國家美國食品藥品監督管理局負責組織制定考試科目和考試大綱，編寫培訓教材，建立考試題庫和考試命題。按照培訓與考試相分離的原則，鞏固和組織考前培訓。人事部門負責組織考試科目、考試大綱和試題。會同國家美國食品藥品監督管理局，監督和指導考試工作並確定合格標準。
考試性質國家執業藥師資格考試屬於職業準入考試。凡符合條件並經考核合格的，由國家頒發執業藥師資格證書，表明其具備執業藥師的知識、技術和能力。這個資格在全國範圍內有效。