1，功效不同:帶核山茱萸具有滋補肝腎、斂精散結的功效，主要用於治療肝腎不足、腰膝酸軟、遺精遺精等癥。無籽山茱萸具有清熱解毒、利尿通淋的功效，主要用於治療熱毒蘊結、小便不利、尿頻尿急等癥狀。
2、使用方法不同:山茱萸用於煎煮，需要粉碎或切碎才能更好的釋放藥效。泡茶或煲湯時使用無籽山茱萸，可直接放入茶包或湯料中，方便好用。