2、治療瘧疾。在我國中醫裏，黃連壹直都是用來治療瘧疾等嚴重腹瀉，黃連中含有黃連素，黃連素具有抑菌抗菌作用，對於痢疾桿菌，結核桿菌，肺炎球菌，傷寒桿菌以及白喉桿菌等具有抑制作用，對痢疾桿菌的作用最強，是治療細菌性胃腸炎，痢疾等消化道疾病的特效藥。
3、治療消化道炎癥。由於黃連苦澀作用，會使黃連素在胃腸道中停留的時間增長，對於消化道嚴重的治療效果明顯。
4、降低血糖，黃連中的黃連素對血糖的調控與藥物的劑量和給藥的方式有關，在治療糖尿病患者時，可適當加入少量的黃連素，能明顯的降低血糖。