中藥化學(成分)指紋圖譜是指通過測定中藥所含的各種化學成分(次生代謝產物)而建立的指紋圖譜。雖然化學成分是次生代謝產物,受生物環境和生長年限的影響,個體間有明顯的差異,但植物的代謝是有遺傳性的,同壹物種的個體在化學成分上也有相似性,所以可以利用化學成分的光譜建立指紋圖譜。中藥化學(成分)指紋圖譜主要包括光譜和色譜,如紫外光譜(UV)、紅外光譜(IR)、質譜(MS)、核磁共振譜(NMR)、薄層色譜(TLC)、氣相色譜(GC)、高效液相色譜(HPLC)、毛細管電泳(ce)以及各種聯用技術。中藥材的化學指紋圖譜對控制中藥材的質量具有更直接和重要的意義。