1.腱鞘囊腫可以自行消失，但需要很長時間。
2.淺表性囊腫可通過外力擠壓、破潰、擠壓或針刺，自吸可治愈，但易復發。
3.非手術治療:通常在囊內容物排出後，向囊內註入0.5ml醋酸潑尼松龍，然後進行加壓包紮。這種方法簡單，痛苦小，復發率低。
4.手術治療:手指腱鞘囊腫壹般較小，不易穿刺；其他部位多次復發的腱鞘囊腫可以手術切除。術中應徹底切除囊腫，如出現腱鞘，應同時切除部分相連的腱鞘；如遇關節囊滑膜疝，應結紮並在根部切除，以減少復發機會。
5.中藥外敷治療:中藥外敷，囊腫外敷。消除囊腫內的濃度，使囊腫逐漸消退。