中藥木瓜是木瓜成熟後，置沸水中燙至外皮灰白色，對半縱剖，曬幹得來；而水果木瓜成熟後即可食用，中藥木瓜和水果木瓜的植物科屬、產地和生長環境不同，兩者的口味、藥性、歸經、功效用途也不同。
中藥木瓜為薔薇科、木瓜屬，是落葉灌木植物貼梗海棠的幹燥成熟果實。而水果木瓜為番木瓜科、番木瓜屬；中藥木瓜產於我國的安徽、山東、湖北、貴州、西藏等地，適宜在亞熱帶溫暖濕潤的山區地帶生長。水果木瓜原產於墨西哥和美洲中部地區，我國主要產於廣東、海南、廣西、雲南、福建、臺灣等，適宜生長在溫暖的地區。