治療期間，飲食也不可忽視。尿路結石患者的飲食原則傾向於低動物蛋白高維生素的素食。對於結石合並痛風的患者，應限制肉食，不吃動物內臟。每天蛋白質的攝入量不應超過90克。少吃菠菜、蘑菇、菜花，多吃水果。尿液堿化在尿酸結石的防治中具有重要意義。宜吃堿性蔬菜、水果，使尿液PH值保持在6，2 ~ 6，5範圍內。
用低鈣食物作為高鈣泌尿系結石的防治方法，可以降低發病率，防止復發。有報道稱，每天服用10 ~ 24g脫脂米糠，連續服用4周~ 2個月，限制鈣攝入量為每天700 mg，可使米糠中含植酸的磷酸鹽與鈣結合，減少鈣的攝入量。
草酸鹽結石的發病率占尿石癥的絕大多數，因此要求限制高草酸、高乙醇酸、高鈣食物的攝入。比如菠菜、土豆、甜菜、蘆筍、油菜、榨菜、果子露、核桃、榛子、李子、草莓、橙子、胡蘿蔔、豆類、芹菜、黃瓜、巧克力、濃茶(紅茶)、海帶、蝦皮、帶魚、糖等都是高草酸食物。青葡萄、酸橙、蘑菇、甜菜、核桃、菠菜、梨、西紅柿和紅薯都是高乙醇酸食物。奶粉是高鈣食品。