目前對銅綠假單胞菌有效的抗生素有三種:β-內酰胺類、氨基糖苷類和氟喹諾酮類。在β-內酰胺類抗生素中，亞胺培南、頭孢他啶、哌拉西林和單環氨曲南具有較高的抗假單胞菌活性，其他包括頭孢哌酮和頭孢噻肟。還有阿莫西林加克拉維酸(安全滅菌)、替卡西林加克拉維酸(特美汀)、頭孢哌酮加舒巴坦(舒巴坦)加β-內酰胺酶抑制劑，也有壹定效果。氨基糖苷類抗生素如阿米卡星、妥布黴素對銅綠假單胞菌有較好的療效。氟喹諾酮類藥物中的環丙沙星和氧氟沙星對銅綠假單胞菌有壹定的抗菌活性。