1.壹般治療小範圍淺表處皮膚黏膜的單純皰疹病損可僅采用局部用藥抗感染治療，對癥狀較重，尤其重要臟器受累的患者則應給予全身性抗感染用藥及相應的對癥支持治療，腸溶阿司匹林口服可用於皮膚黏膜皰疹部位疼痛顯著者，生殖器皰疹患病期間應禁止性生活，對某些患者而言，應與易感人群實行必要的隔離。
2.抗感染治療淺表處的皰疹病損可以局部用藥，例如3%阿昔洛韋軟膏或0.5%碘苷(idoxuridine)軟膏塗搽患部，疑有細菌性感染者，可外用金黴素或新黴素軟膏，中藥藤黃系藤黃科植物分泌的壹種幹燥膠質樹脂，具有抗皰疹病毒，抗菌消炎，止痛收斂等作用，據報告，以30%藤黃酊1次/d或2次/d外搽患部，對於生殖器皰疹的淺表處病損有較好的療效，由於眼部皰疹可能造成嚴重後果，故應積極治療;采用0.1%碘苷滴眼液滴眼，1次/h，病情緩解後可延長給藥間歇，病損面積較大者也可外用3%硼酸濕敷局部。
對病情較重者或局部用藥難於奏效者，應采用口服或註射途徑進行抗病毒藥物的全身性用藥：反復發作的生殖器皰疹患者可口服阿昔洛韋200mg/次，5次/d，***7天;也可口服鹽酸伐昔洛韋300mg/次，2次/d，***7天，個別病例可能對阿昔洛韋過敏，應予註意。
伐昔洛韋口服後能迅速被吸收，在體內轉變為阿昔洛韋，其生物利用度是阿昔洛韋的3～4倍，因此，同等療效下可降低藥物用量，減少其不良反應，重癥患者應靜脈滴註阿昔洛韋5mg/kg體重，1次/8h，***5～7天，用藥期間應多飲水，或在必要時予以靜脈補液，以避免阿昔洛韋在腎小管內析出結晶，導致腎損害。
亦可用更昔洛韋5mg/kg體重，緩慢靜脈滴註，1次/12h，***1～2周，更昔洛韋的不良反應相對較大，可能導致白細胞，血小板數量減少，故用藥期間，應監測血象變化，由於伐昔洛韋是阿昔洛韋的L-纈氨酰酯，更昔洛韋是阿昔洛韋的衍生物，對阿昔洛韋過敏者，禁用此兩種藥物，此外，也可試用膦甲酸鈉，對於較重的患者，尚可聯合使用幹擾素α。
上述藥物的作用靶點是病毒的DNA多聚酶，臨床上已發現壹些毒株表現出不同程度的耐藥性，因此，目前正在開發針對不同靶點的抗病毒新藥。
對單純皰疹反復發作的患者，可使用增強免疫功能的藥物，如左旋咪唑50mg/次，3次/d，每2周內連服3天為壹療程，常需連服數月;也可使用轉移因子，胸腺素等，復發性生殖器皰疹的特點是每次復發多在同壹部位，對固定在陰莖包皮處反復發作皰疹的患者，可以試行包皮環切術控制或減少其復發。
(二)預後
單純皰疹病損有自限性，患者的全身癥狀大多較為輕微，壹般預後良好;但發生於特殊部位的皰疹損害則有可能導致嚴重後果，值得警惕，此外，新生兒及各種原因造成的免疫力低下者感染單純皰疹病毒後，則可能播散累及重要臟器，預後嚴重。