醫學上壹般按藥物性能和藥理作用分類，中醫學常按藥物性能分為解表藥、清熱藥、祛風濕藥、理氣藥、補虛藥等類別；現代醫學常按藥理作用分為鎮靜藥、鎮痛藥、強心藥、抗癌藥等。藥用植物學按植物系統分類，則可反映藥用植物的親緣關系，以利形態解剖和成分等方面的研究。中藥鑒定學、藥用植物栽培學常按藥用部分分類，分為根、根莖、皮、葉、花、果實、種子、全草等類，便於藥材特征的鑒別和掌握其栽培特點。
植物的化學成分較復雜，有些成分是植物所***有的，如纖維素、蛋白質、油脂、澱粉、糖類、色素等；有些成分僅是某些植物所特有的，如生物堿類、甙類、揮發油、有機酸、鞣質等。
各類化學成分均具有壹定的特性，壹般可由藥材的外觀、色、嗅、味等作為初步檢查判斷的手段之壹。如藥材樣品折斷後，斷面不油點或擠壓後有油跡者，多含油脂或揮發油；有粉層的多含澱粉、糖類；嗅之有特殊氣味者，大多含有揮發油、香豆精、內酯；有甜奈者多含糖類；味若者大多含生物堿、甙類、苦味質；味酸者含有有機酸；味澀者多含有鞣質等等。 植物分類的方法 壹人為分類方法 是人們按照自己的方便或按植物的用途，選擇植物壹個或幾個特征作為標準進行分類，然後按照人為標準順序排成分類系統。 二自然分類方法 以植物的親疏程度作為分類的標準。按照生物進化的觀點，植物由於來自***同祖先而具有相似的遺傳性，表現出形態、結構、習性等方面的相似。因此，根據植物相同點的多少就可判斷它們之間親緣上親疏程度。這種根據親緣關系進行分類的方法是自然分類方法。 被子植物的分類主要依據各種器官的形態特征，尤其是生殖器官的形態特征，因為花果的形態比較穩定，不易因環境的改變而產生變異。 二、植物的分類單位 依範圍大小和等級高低，植物分類的各級單位依次是界、門、綱、目、科、屬、種。每個等級內如果種繁多還可細分壹個或二個次等級，如亞門、亞綱、亞目、亞科等。種以下可有亞種、變種和變型。 種是分類學上的基本單位，同種植物的個體起源於***同的祖先，具有相似的形態特征，能自然交配產生遺傳性相似的後代，要求相同的生態環境條件，有壹定的自然分布區。品種不是分類單位，不存在於野生植物中，是栽培學上的用法，相當於變種或變型。 在分類上，親緣相近的種歸類為屬，相近的屬歸類為科，相近的科歸類為目，以此上推直至把所有植物歸類為植物界。