境內屬於亞熱帶常綠闊葉林區，森林覆蓋率達32%，是全省首個達到綠化標準的城市。林木約437種，多為國家保護植物和珍稀樹木。如水杉和銀杏，珍貴的蘇鐵，紅豆樹，桂樹和特有的柏樹和榕樹。經濟林主要有油桐、油橄欖、牛油、核桃、蓖麻、棕櫚等。境內盛產柑桔、橙、柚、梨、桃、李、蘋果，其中沙田柚、青蘋果、紅橙、“貢橙”等品種品質最佳，享譽省內外。動物資源種類繁多，主要脊椎動物約237種。魚類資源89種，兩棲類中華鱘、烏魚、巖鯉、喙魚、大鯢、哺乳動物水獺等珍稀動物均為國家和省級保護動物。糧食作物以水稻、小麥、玉米、高粱、紅薯為主，各種豆類遍布全市。經濟作物有棉花、油菜、花生、芝麻和甘蔗。遂寧黑芝麻有很高的食補價值；蜀都牌碘化芝麻油是國家發明專利產品，其濃香型芝麻油是四川省名牌產品。市中區楊杜壩的胡豆，曾經是朝廷的貢品。
蔬菜主產鎮郊區平壩地區，不僅滿足本地消費，還暢銷重慶等地。主要有白菜、甘藍、菜花、蘿蔔、茄子、豇豆、四季豆、番茄、黃瓜、辣椒、蒜薹、大蔥、芋頭等。近年來，大棚蔬菜的出現，解決了居民的淡季蔬菜需求。胡愛山山具有很高的食用和藥用價值，是遂寧的特產，壹年四季都有銷售，具有深加工價值。魔芋在農村已廣泛種植，其特殊的營養和消腫功能也是生產肥胖患者減肥食品的重要綠色植物，具有很高的開發價值。射洪蘇家Suan蒜白而壯，搗成蒜泥隔夜不變色，為蒜中上品。
中草藥有127種，在植物中居第二位，具有很大的開發價值。中部地區的“菊花心”白芷是遂寧的特產，聞名全國，最高年產量達百萬公斤，占全省年產量的70%。行銷中國城鄉，遠銷東南亞、日本、法國等地，被譽為白芷之鄉。半夏是本市質量最好的野生藥材。是明朝地方官員向皇帝進貢的。民國時期，壹些外國公司將遂寧半夏銷往德國、日本、印度、馬來西亞等國，最高年產量達6萬公斤。本市自然條件適宜半夏生長，野生變家養發展前景良好。此外，廣藿香、薄荷、土荊芥、麥冬、紅花、丹參、白芍、荊芥等中藥材已大面積種植，產量高，品質優，可供選擇開發加工。夏枯草、金錢草、鱗翅目等野生藥材更為群眾所熟悉，可以直接浸泡飲用。魚腥草(側耳根)和牛心樸子兼具藥用和食用價值。它們被郊區菜農當作野菜出售，深受消費者喜愛。
水果29種，其中數量最多的是柑橘紅橙和寬橙，面積近20萬畝，產量3.5萬噸。有蓬溪何家壩柚、遂寧沙田柚、射洪矮牽牛山柚、漳州柚，其果實或個頭大，口感清甜，或大小適中，甜度適中，適合不同消費層次。每年供不應求，價格上漲，已在合適的城中村進行。柑橘有無核錦橙、臍橙、橙橙等品種，檸檬品種以尤裏卡為主，集中在大英縣河邊鎮。是全省第二大檸檬產區，具有良好的出口加工能力。全市種植桃、李、梨、葡萄、枇杷、櫻桃。