藥用植物資源的開發利用，就是要充分發揮人的主觀能動性，依靠先進的科學技術和各種有效措施，保證這種資源的供給和合理利用，以預防和治療疾病。
包括兩個主要方面，即如何有效利用藥用植物資源，如擴大資源，保護和促進其再生能力，改變或創造種質特性，不斷提高產量和品質，以充分滿足藥用需求；另壹方面，通過調查和多學科綜合研究，不斷發現新的具有較高治療價值的藥用植物，使這壹資源不斷豐富和充實。兩者相輔相成，相互促進；更好地為人民健康服務。
藥用植物資源的開發利用，從科學研究的角度來看，可以包括以下內容。
壹、植物區系調查、總結和規劃
某壹地區的人們所使用的藥用植物的總種類構成了該地區的藥用植物區系。內容包括種類、儲量、產量、生態因素、更新途徑、利用前景等。，根據具體情況制定相應的規劃，是資源開發利用的戰略基礎。在調查中，除了表面調查外，還要突出重點，關註那些具有較大經濟價值和藥用價值的物種，關註該地區藥用植物獨特的使用經驗(如民間秘方、驗方等。)為新藥開發創造良好條件。
第二，野生資源的保護和更新
通過調查，對於壹些具有大量野生資源的重要物種(如甘草。、黃芩、刺五加、穿山龍等。)，必須采取人工保護措施，制定政策，促進這些藥用植物的繁殖和再生能力，防止大量具有繁殖能力的個體遭到破壞，其生長地的生態環境遭到突然破壞，並采取合理的、有計劃的采收，依次封山以保證個體的恢復和發展，采取人工措施擴大個體的繁殖系數。壹般來說，這些技術措施應納入該地區的總體規劃，以確保其順利實施。
藥用植物的引種馴化與栽培
這是資源開發利用中保證資源數量和質量的最有效措施。人參、三七、黃連、當歸、附子等壹批重要中藥材，通過人工栽培，已逐步滿足需求。近年來，通過弄清天麻的生活史和蜜環菌與萌發真菌之間的生長規律，將野生天麻引入國內栽培取得了很大的成功。通過對重要的進口南藥砂仁在我國雲南和海南的引種馴化和大面積種植，取得了明顯的經濟效益和社會效益。還有壹些重要的野生藥用植物，如肉蓯蓉、鎖陽、豬苓等。有必要對它們的生活史、生物學特性、生態條件等做深入細致的調查研究。，從而促進人工大規模培養的成功。
第四，藥用資源的拓展和利用
目前廣泛采用的方法是以能代表該植物療效的主要有效成分或部位為指標，從親緣相近、資源豐富的植物類群中拓展資源，或通過拓展藥用部位來充分利用資源。
如前者通過植物、生藥、化學、藥理、臨床的比較研究，成功地從《中國植物誌》中找到了安息香、馬錢子、沈香、胡黃連、雅辛托斯等國產資源和進口藥物。
另壹個例子是產生激素的類固醇原料植物。以薯蕷皂苷元等甾體皂苷元為指標，發現薯蕷屬(組)許多植物的根莖。中國植物區系中的甾體皂苷元含量較高。其中，盾葉薯蕷的含量為1.05-16.15%，穿龍薯蕷的含量為1.36-4.60%，三角葉薯蕷的含量為6544。
這種需求也促進了對藥用類群的深入研究，如東莨菪堿、人參、附子、大黃、丹參、延胡索、細辛等。
擴大藥用部位和藥用植物原料的綜合利用，使資源得到充分利用。前者從鉤藤的鉤擴展到莖，從砂仁的果實擴展到葉，提取砂仁揮發油。後者如唐古特莨菪，已開始綜合使用阿托品、東莨菪堿、樟柳堿、後馬托品和蝙蝠葛堿。小檗不僅使用小檗堿，還使用了另壹種含量較高的成分——小檗胺。
第五，通過半合成的方式擴大藥用資源。
這是壹個相對年輕但很有前途的資源利用領域。
壹種是用有機合成的方法，把植物中的某種成分變成需要的藥物。如延胡索中僅含0.1-0.2%的延胡索乙素，如果從黃藤莖中提取延胡索乙素，氫化成延胡索乙素，可大大提高產量，降低成本。
第二，應采用藥理學和臨床相結合的有機合成方法，改造植物中某些有效成分的結構，以獲得高效、低毒或生物利用度更高的藥物。比如從丹參中提取的丹參酮ⅱA，經過磺化後，可以大大增加水溶性，從而獲得更好的療效。再比如秋水仙堿用氫氧化銨水解得到的秋水仙堿酰胺，毒性更低，抗癌譜更廣，安全範圍更廣。
不及物動詞生物技術在資源開發中的應用
比如藥用植物的組織培養，就是利用植物組織或細胞通過無菌的體外培養產生愈傷組織的方法，愈傷組織可以被誘導分化成完整的植株或產生有效成分。由於其生長速度快，生產周期短，可工業化大規模生產，越來越受到人們的關註。通過組織培養，獲得了大量的人參皂苷和紫草素，有望進入實際大規模生產的實用階段。
通過采用快速繁殖、細胞融合、雜交育種等生物技術，將生產出許多療效更好、毒副作用更小、產量和質量遠高於傳統生產方式的藥用植物新品種。
生物新技術在中國的應用起步較晚，但這壹領域將有非常光明的未來。
七、藥用植物資源的二次開發
當我們用生物和農業方法成功地進行藥用植物產量和質量的第壹級開發時，我們必須同時積極地進行以工業手段為主的第二級開發，以促進藥用原料植物和藥材再次加工制造成適宜的藥物、藥品或其他成品(如保健食品、保健飲料和美容產品)。
八、藥用植物新資源的開發與研究
藥用植物資源利用的壹個極其重要的內容是不斷從當地植物區系中發現新的功效突出的藥用植物資源。
中國是壹個使用中草藥歷史悠久的國家，在長期的實踐中積累了豐富的傳統藥理學知識。有計劃地調查和總結這壹經驗，並運用多學科和現代科學手段加以發揚和完善，不僅對開發藥用植物資源，而且對我國新藥創制都具有重要意義。中國在這方面有很多成功的例子。
例如，通過對生長在青藏高原的藏藥東莨菪的系統研究，發現了兩種新藥山莨菪堿和樟柳堿。除了具有明顯的抗膽堿能作用外，最近發現它們具有良好的促進微循環作用，已廣泛應用於臨床。
中國長白山地區壹位老農用仙鶴草的冬芽驅除絳蟲，效果很好。經過系統研究，發掘出壹種驅絳蟲效果好的新藥——鶴草酚。
又如從傳統抗瘧藥黃花蒿中開發出有效的抗瘧藥成分和新藥青蒿素，具有良好的抗瘧藥效果，引起國際關註。
九、藥用植物資源開發的基礎工作
在這方面，除了建立藥用植物標本館、藥用植物園和藥用植物數據庫外，還要特別重視藥用植物種質資源的保護和管理，因為種質的流失是不可逆的，是今後育種工作不可缺少的物質基礎。特別是很多珍貴的中藥材都是瀕危或瀕危物種，植物園和自然保護區要加強這方面的工作，比如建立藥用植物的種子庫和基因庫。
X.藥用植物系統發育學在資源開發中的應用
為了更有效地開發利用藥用植物資源，需要運用多學科的綜合手段和基礎理論的指導，藥用植物系統發育學在這方面可以發揮巨大的作用。其主要任務是探索某壹植物類群中植物親緣關系、化學成分和療效之間的內在規律，以指導今後的實踐。