深圳市藥品檢驗所高度重視人才培養，不斷加強隊伍建設，打造了壹支年輕化、專業化的技術人員隊伍。研究所現有工作人員120人，總人數的80%以上具有本科以上學歷，其中博士8人，碩士35人。國家藥品和保健食品審評專家、兼職教授、碩士生導師、地方級專業人員成為技術骨幹。為了適應藥物檢測技術的快速發展，近年來配備了紅外激光拉曼光譜儀、HPLC-MS-MS、GC-MS-MS、電感耦合等離子體發射光譜儀、差示量熱掃描儀、熱重分析儀等現代化精密儀器。全面開發和應用實驗室管理(LIMS)和科學數據管理(SDMS)系統，將檢驗和測試納入高效、可控和可追溯的信息軌道。研究所資產2億元，其中儀器設備資產超過1億元。儀器設備水平和信息技術應用處於全國領先行列。按照“科學、公正、優質、高效”的質量方針，建立健全了覆蓋全過程、全方位、全員參與的管理體系，制定並實施了質量手冊、程序文件、作業指導書、記錄表格等四級體系文件。2004年，首批中國實驗室獲得藥品檢測行業認可，檢測結果獲得國際通行。
深圳市藥品檢驗所作為藥品質量技術監督的藥品檢驗機構，全面實施國家和地方基本藥物品種和重點藥物品種的質量抽查和質量評價；要努力開展社區診所和零售藥店的快速檢驗方法，現場檢驗藥品的真偽和優劣；積極應對非典、甲型流感(H1N1)等突發事件的藥品質量保障任務，成為政府監管藥品質量的有力技術支撐。2007年，率先鑒定出冬蟲夏草、燕窩、人參等名貴中藥材。以及性保健品、減肥產品、美白化妝品中鉛、汞的檢驗。為人民群眾的健康築起了壹道貼心安全的防火墻。建立了藥品醫療器械生物安全性評價和藥物分析檢測研究兩大服務平臺，向社會開放，動態開展企業檢驗能力評估和高風險藥品生產企業檢查，全力推進微生物檢驗重點實驗室和GLP實驗室建設，為醫藥產業發展提供堅實可靠的技術服務。
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