辨證論治是中醫各種內外治方法應遵循的基本原則，膏方治療也不例外，應在辨證論治原則的指導下進行。中醫學在長期的發展中，形成了許多辨證方法，如六經辨證、八綱辨證、衛氣營血辨證、三焦辨證、臟腑辨證等。各種辨證方法都有其相對適用的病癥和適用條件。由於膏方的治療對象以內傷雜病為主，且多為多年患病，對臟腑影響較深，故以臟腑辨證為主，這也是目前臨床上大多數醫生采用的辨證方法。
臟腑辨證包括對疾病的部位、性質和嚴重程度的判斷。
病位是指疾病發生的病變器官的位置。因為每個臟腑都有相對獨立的生理功能，其外在的生理現象也各有特點。臨床上通常根據可觀察到的外部異常表現來判斷病變器官，如咳嗽、咳痰、喘息、氣短等。但有些生理功能需要兩個或兩個以上的器官來完成，比如呼吸運動，需要肺腎的配合。肺部疾病晚期，在運動時出現氣短，甚至在安靜狀態下呼吸變淺，所以要位於肺腎兩處，肺腎兩處壹起治療。此外，判斷病位，要掌握病臟的傳變規律，結合“治未病”的思想，不僅要正確判斷病臟，還需要對病臟進行合理的動態預測。如果肝氣郁結，可侵犯脾臟，導致肝郁脾虛；肝火過盛，可燒肺有炎，有木火。在分析疾病位置時，應考慮這些傳播趨勢。
病理是指疾病病理變化的本質屬性，如陰陽、表裏、寒熱、虛實等。膏方治療的辨證要點是寒熱、虛實。正如《蘇文·陰陽應象大論》所說:“好診病，查色切脈，先別說什麽陰陽。”寒熱代表了疾病過程中陰陽的消長。陽虛即外寒，陰虛即內熱，陽盛即外熱，陰虛即內寒。虛擬現實代表了善惡的進退，“本質被拿走了，罪惡滿滿，卻是真實的”。兩者結合可以反映疾病的基本狀態，如虛寒和實熱。
疾病的嚴重程度是指疾病過程中善與惡相互作用的結果，對機體的損害程度和預後的好壞。所以需要從善惡兩方面來分析。如果正氣不足，則表現為局部的、單個的臟器，不損害臟腑的組織結構和根本功能，不危及生命，否則有危險。比如氣虛單純表現為脾虛，厭食者臨床表現為輕度；如果進食量進壹步減少，面色萎黃、精神疲勞者就會加重；更進壹步，如果水谷不前進，他將幾天不吃飯，那些疲憊和冷漠的人將有危險。致病因素也是如此，比如熱侵局部腫痛者較輕，口渴易怒者如伴有體熱旺盛、惡寒則較重。如果瘡面看起來暗沈，瘡面頂部再次塌陷，並伴有譫妄或譫妄，那就危急了。善與惡是矛盾的兩個方面，它們鬥爭的結果決定了疾病的嚴重程度，所以在臨床判斷時要綜合考慮。
在臨床上，需要綜合疾病部位、疾病性質、疾病嚴重程度的診斷，明確疾病目前最本質的狀態，為治療提供正確的指導。
此外，也有醫生強調膏方治療不僅要辨證，還要辨體質，即對患者基礎體質的陰陽虛實做出合理判斷，作為膏方治療的依據。這也是臨床上應該掌握的壹個重要原則。壹般來說，患者的基本體質與其疾病的主要證候有內在聯系。比如哮喘不同於寒哮、熱哮，陽虛體質的人容易患寒哮，陽虛體質的人容易患熱哮。陰陽兩虛與體質實證的區別，往往取決於疾病的易感證型。在臨床上，也存在著疾病的性質與其基本體質相互屏蔽的現象。因為體質是先天稟賦、後天飲食、環境、氣質等決定的。，壹般是穩定的，疾病的性質受善惡鬥爭的強弱、治療措施的適當性、飲食護理的影響，可出現明顯波動，與基本體質出現矛盾。以哮喘為例，陽虛體質的人容易患感冒、哮喘，但在病程中可因痰飲郁結而轉化為熱，導致整體虛寒，局部實熱。此時要綜合考慮整體和局部，處理好體質和疾病的關系，把握好治補退熱的尺度。
(2)尋求和平
根據中醫理論，正常的人體應該是壹個能夠在物質和功能上保持動態平衡的有機體，這就是所謂的“任平”。這種理想狀態叫做“和諧”，這種狀態的破壞會導致疾病。所以藥膏治療的根本目的是恢復平衡，再次達到“和”的境界。
膏方治療的疾病多為慢性疾病，常伴有正能量不足和惡愛，寒熱錯雜，其病機壹般較外感疾病和急性病復雜。理論上來說，所有的治療方法都應該是逆著疾病的趨勢去的，比如感冒的和熱的，感冒的。但由於軟膏治療患者臨床情況的復雜性，單壹的治療方法往往達不到滿意的效果，有時甚至會導致病情的加重。所以要處理好疾病過程中的各種矛盾，在尋求平衡的過程中把握好治療方法的平衡。就像吳鞠通說的:“治內傷如治。”在臨床治療中，主要處理好攻補平衡、寒熱平衡、動靜平衡、升降平衡。
攻補平衡:慢性病往往表現為以虛為主的臨床過程，虛實夾雜的證候多為虛，不能標本兼治，不能去，也可以用扶正祛邪，使邪去正，邪滿畏，正確的治療才是正確的。如果堅持以膏方為補劑，大量塗抹補品，不管對象中的邪，邪勢旺盛，正氣被侵蝕，補劑的好處看不到，反而正氣受損日益嚴重；更何況，滋補滋補的貨都是愛惡的，起不到滋補的作用。所以癥狀要當* * *，如下:“正必伴以瀉邪，邪去則自固”。現代著名學者秦伯未說“藥膏不是簡單的補藥，而是含有治病救人的意思”。
寒熱平衡:“寒則熱”、“熱則寒”是壹個經典的治療原則，但在臨床上也經常遇到壹些患者，雖然是陽虛，但吃了幾劑溫藥後就感到煩躁、發熱，口幹舌燥，甚至出現鼻衄、口瘡。因為人體是陰陽的統壹體，它在不斷地動態調整。如果不考慮人體自身的調節，壹見陰寒就容易動龍雷之火，壹見陽熱就冷，那麽脾胃的生化之氣就會被切割。膏方以補為主，補藥尤其是補氣壯陽的藥物以溫性為主，需要加入適當的寒性、寒性藥物來監督其溫性，使整個膏方中的寒熱性趨於平衡；但滋陰補血的藥物多為油膩性寒涼。如果不用溫性藥物代替，脾胃會因粘陰寒而不利，臟腑失養，易受邪氣侵襲。所以，只有妥善處理好藥膏中的寒熱，才能治病救人，挽救偏差。
舉人平衡:舉人，什麽都沒有。人體的永恒活力是由於不斷的氣運動。上升時會自然氣化生物，下降時會陽光普照眾生。出門就吐，人就新；動則動全身，靜則守中樞，神則藏，但最重要的是，有條不紊地起落，平衡人，動靜相宜。人體的升降運動是臟腑生理功能的基礎，同時五臟各有其氣來發揮其生理功能。因此，在處方時，要考慮各器官的生理特點和藥物的升降變化，積極控制靜、動態藥物的差異，正確處理動態與靜態藥物的配伍應用。開膏方時，特別適宜橫向調整標高，使中焦氣機標高有序，使清陽上升，濁陰下降；肝主左升，肺主右降，二者相互配合，輔助中焦升降。欲填精養陰，宜靜，欲補氣血，宜動；若方藥以祛痰、行氣、活血、溫陽散結為主，則應酌情添加滋陰、收斂、固本之品，防止升散過度或搶奪其陰津；以填精補腎、滋陰養血、益氣養元為主，還應輔以理氣、活血、通絡之藥，以防氣滯而致飽脹不適。
(3)呵護胃氣
胃腑是水谷腐爛和發展微妙之處的重要地方。在生理狀態下，它需要提供養分和能量，在疾病狀態下，它需要依靠它提供的精微物質來滋養正氣，從而抵禦邪氣。而且口服藥物也需要胃氣的運輸和吸收才能發揮藥理作用。
所以調藥膏的時候要註意保護胃氣。如果脾胃健康，運化功能好，治療時稍微註意壹下就行，不要弄得太油膩，太苦。也可以塗上砂仁、陳皮、砂仁等壹兩種助運劑。
如果是脾胃虛寒或者慢性病，就要根據具體情況進行調整和治療。若胃氣較弱，則以加入白術、枳實、雞內金等藥物理氣助運為佳。如果胃腸激素稀薄，容易腹瀉，就要慎用油膩、寒涼的藥物。如果木醋液介質濕濁，則不應油膩。可適當加入藿香、飛機草、蒼術、厚樸等草藥。