中藥裏的雄黃毒性很大；何首烏含肝毒性，三七腎毒性嚴重。此外，壹些中藥含有馬兜鈴酸，可導致嚴重的腎衰竭。這說明中藥不是沒有毒性的。中醫只能在優秀的中醫身上發揮作用，那些用普通中醫的庸醫也能讓人吃出問題。所以中醫在優秀的中醫手裏副作用很少，而西醫不管誰用，副作用肯定是存在的。
有些中藥在壹定劑量範圍內對人體無毒，但超過安全劑量也會產生毒副作用。或者藥物本身不產生毒副作用，但是盲目服用，也會加重癥狀，而且越治療越涼或者越熱。中藥的副作用壹直是中醫非常重視解決的問題。可以根據不同的年齡、性別、癥狀，用最合適的劑量達到理想的效果，盡量避免中藥劑量不當造成的後果。目前，藥物很難廣泛進入國際市場。他們願意的原因壹是療效確認，二是成分復雜，毒副作用難以控制。所以不能絕對認為中藥比西藥毒副作用小。
很多人認為中藥性質溫和，不吃也能治病防病，但他們忽略了藥物有三種毒性，都有毒素，這就是藥物的價值。沒有毒素的藥材不叫藥材。因此，不宜長期服用中藥。“辨證論治”是處理內科疾病的絕妙思維，是真正解決疾病問題的正確路線。