旱地果園只適合套種耐旱中藥材，如柴胡、黃芩、黃芪、知母等。水地果園可套種元胡、附子、北沙參等。山區果園宜套種黃連、黨參、麥冬、西洋參等。在林下套種中草藥的過程中，要堅持地藥適宜的原則，結合立地條件進行綜合分析，確保所選樹種在土地和氣候條件上具有良好的適應性，有助於順利栽培。
合適的藥材品種包括枳殼、吳茱萸、梔子、杜仲、黃柏、厚樸等。，壹起種植的作物品種有花生、芝麻、榨菜、西瓜、矮生和耐陰藥材等。要讓幼苗的根系在池塘中自然伸展，並把土壤填得密實，使根系與土壤緊密結合。在種植的過程中，要註意保護幼苗不受損傷，尤其是根部不能暴曬，暴曬時間過長。
林下種植中草藥，會增加植被，改善土壤和地下的生存環境。更多的物種植被會加強光合作用，釋放更多的氧氣，增加空氣中的濕度，降低森林火災的概率，從而保護生態環境。幼齡果園可套種1-3年采收的地黃、黃芩、菊花、黃芪、牛膝、板藍根、決明子、白術、柴胡等中藥材。成年果園應選擇喜陰或耐陰的中藥材套種。