胸心外科是鄂爾多斯市中心醫院的重點學科。是鄂爾多斯高原第壹次亮起的璀璨明珠。心血管外科的發展帶動了其他學科的發展，因此在創建“三甲醫院”的過程中起著非常重要的作用。泌尿學
鄂爾多斯市中心醫院泌尿外科經過近50年的建設，已經成為壹個實力雄厚的學科。65438-0950胡主任專攻泌尿外科，當時配合普外科診治泌尿外科疾病。泌尿外科專業群成立於1992，泌尿外科成立於1997。連同心胸外科，它有壹個護理單元，有23張病床和7名專家。其中主任醫師1名，副主任醫師1名，主治醫師2名，住院醫師3名，有去天津、北京泌尿外科研究所進修的計劃，符合國內先進技術。
神經外科
神經外科是鄂爾多斯市中心醫院的優勢學科，開放床位46張，設施齊全。有重癥監護室、搶救室、術後復蘇室，還有三臺多參數生命體征監護儀、三臺呼吸機、腦立體定向儀、顱內壓監護儀等高科技儀器。* * *擁有23名醫護人員，每年進行300多例神經外科手術。
骨科
1972，鄂爾多斯市中心醫院成立了專門的骨科團隊，1978，成立了骨科，1987，骨科分為兩個科室。三病區:四肢創傷與關節外科；四個病房:脊柱外科、手外科、小兒骨科、骨腫瘤。床位90張，其中主任醫師7人，副主任醫師5人，研究生3人，1副主任護師，主管護師4人。婦科和產科
主任醫師3名，副主任醫師6名。主治醫師2名，主管護士10名。主任:周仲瑛主任醫師。自治區婦產科學會常務委員會。副主任:黃副主任醫師，自治區婦產科學會常委。主任助理:楊秀貞，主任醫師。婦產科技術力量雄厚，管理規範，能開展三級甲等醫院婦產科重點學科的全部工作。
小孩子把戲
鄂爾多斯市中心醫院兒科成立於1960。在歷屆院長和科長的帶領下，經過40年的努力，三個醫學生和內科利用科室成立時單壹的護理單元、病房和簡陋的設備，發展成為壹支技術力量雄厚、基礎設施完善、管理嚴格的學科隊伍。心血管內科
鄂爾多斯市中心醫院心血管內科歷史悠久。早在醫院建的時候，就有心血管內科。老壹輩的醫務工作者為我們打下了良好的基礎。1975成立了以心血管疾病為主的內科，使學科有了更大的發展。2002年心血管科正式成立，為這個學科的發展創造了更大的空間。2005年被評為市級重點學科，2006年被聘為內蒙古醫學院研究生培養中心。
腹部外科
鄂爾多斯市中心醫院普外科成立於1950，隨著醫院的發展而茁壯成長。鄂爾多斯市中心醫院歷經多年風雨，已成為專科人力資源豐富、專業技術力量雄厚、醫療基礎設施優良、綜合醫療環境和諧的大型特色科室。
眼科學
眼科的歷史發展:眼科專業從1950鄂爾多斯市中心醫院成立開始出現。當時屬於鄂爾多斯市中心醫院耳鼻喉科。眼科專家李宗華主任，1955畢業後分配到鄂爾多斯市中心醫院，壹直從事眼科工作，直至退休。70年代末眼科門診成立後，眼科專業有了真正的分支，業務範圍不斷擴大。當時可以開展的主要業務有白內障摘針、青光眼濾過手術、斜視矯正、眼外傷手術治療、驗光配鏡服務。耳鼻喉科
耳鼻咽喉頭頸外科是鄂爾多斯市具有傳統優勢的重點學科，已有40多年的發展歷史。它是鄂爾多斯市耳鼻咽喉疾病診斷和治療的研究中心。現有專業醫務人員19人，其中主任醫師1人，主治醫師3人，住院醫師4人，護士11人，其中研究生2人，床位20張。口腔科鄂爾多斯市中心醫院口腔科成立於1980，是壹個專業技能較強，集科研、教學、臨床為壹體的獨立學科。現有醫護人員12人，均為口腔科畢業，其中主任醫師2人，均畢業於北京大學口腔醫學院，其主治醫師和住院醫師分別畢業於哈爾濱醫科大學、內蒙古醫學院和通遼民族大學。
燒傷整形科
燒傷整形外科是集醫療、教學、科研為壹體的綜合性科室。專任人員13人，其中專任高級職稱1人，副高級職稱1人，中級職稱3人，初級職稱8人。擁有床位15張，配備大型紅外線治療儀、呼吸機、翻身床、心電監護儀、剝皮機、剝皮機、四肢面部塑料袋、吸脂器、微波治療儀等。
皮膚病學
皮膚科是鄂爾多斯市中心醫院集臨床、科研、教學於壹體的臨床科室之壹。成立24年來，由於設備短缺、技術落後、功能單壹，逐漸發展成為鄂爾多斯市的皮膚科醫療、教學、科研中心。承擔了大量的臨床和教學任務，吸引了眾多本市及周邊地區的皮膚科患者前來就診，年門診量超過25000人次。感染性疾病科成立30年，以過硬的技術、熱情負責的態度、周到的服務吸引了全市及周邊地區如陜西、山西、巴盟、烏海等地的患者。
鄂爾多斯市中心醫院皮膚科目前主要設備有:SS-03AB皮膚光療儀、窄波UVA光療儀、微波治療儀、高頻電離治療儀、負壓表皮分離機、中藥智能熏蒸儀、液氮冷凍治療櫃、奧林巴斯光學顯微鏡、伍德氏燈診斷儀恒溫培養箱等。門診設有2個診室，包括1真菌室、治療室、光療室、過敏室、中藥汗蒸室、美容治療室，廣泛用於各種皮膚病的診療。
腫瘤科
腫瘤科成立於2003年，集化療和放療於壹體。現有床位20張，醫務人員15人，其中醫生6人，主任醫師1人，副主任醫師2人，主治醫師1人，住院醫師2人，物理師1人，護士8人。
外科麻醉學
外科麻醉科成立於1981。經過多年的不懈努力和拼搏，現已成為內蒙古自治區中西部地區同級醫院中規模較大、技術力量較強的專業學科之壹。2002年被評為鄂爾多斯市重點學科。外科麻醉科總人數為43人。