中醫認為，疼痛是由於正氣不足，外防不固，邪氣乘虛而入，導致氣血凝滯，經絡不通所致。《蘇文痹論篇》雲:“風、寒、濕相混，合為痹。”《蘇文俱痛論》也說:“寒氣入經雖遲，但不可泣。客在脈外，血少，客在脈中，氣絕，所以痛。”《靈樞·五輸金別野》也說:“五谷之津液，合為糊狀，滲入骨隙，滋養腦髓，流下陰大腿。陰陽不和，津液就會溢出，向下流到陰，髓液就會減少。過則無力，所以腰酸背痛。”說明痛證的成因無非是虛實兩端，虛即“失節即痛”；其實就是“不行就疼。”
(1)“梗阻致痛”是實性疼痛綜合征發病機理的關鍵。“不通則痛”是指疼痛的發生，不管什麽原因，都是由於邪氣阻滯經絡，氣血不暢所致。中醫認為人體的經絡和氣血應該是“周而復始，周而復始”的。如果受到外邪侵襲，就會造成氣血瘀滯受阻，使臟腑經絡失衡，氣血運行不暢。“堵了就疼。”其病機變化主要包括以下幾個方面。
1.
氣滯:氣帥為血，氣動為血。如果心情不舒服，生氣抑郁，欲望得不到滿足，肝氣就會郁結，氣郁血瘀。胸肋氣滯可引起胸肋疼痛；氣滯上焦所致的胸痛；中州氣滯胃痛。氣滯少腹腹痛；子宮氣滯痛經；經絡氣滯導致肢體疼痛。但是，氣機升降主肺，氣機升降主疏肝，以脾胃為樞紐，所以氣滯所致的疼痛與這三個臟腑關系最為密切。
2.
寒邪郁結:寒性導致郁結，容易引起經絡蜷曲、緊縮、收縮，使氣血運行不暢，引起疼痛，尤其是陽虛者。寒客孫致頭頸部強烈疼痛，全身關節疼痛；寒性太陰腹痛；寒氣襲少陰，致胸痛；厥陰寒，頂痛；經絡寒凝導致肢體肌肉疼痛。
3.
熱邪郁結:經典上說“百病、腫、痛、酸、驚皆屬火。”說明熱邪郁結會影響氣血運行，熱邪燒血、熱傷血陰均可導致氣血郁結。若熱積於肺，傷肺絡則胸痛；肝膽熱郁，肝膽絡脈灼痛脅痛；肝火擾經竅，可見頭脹痛、目赤痛；熱致陽明，腑氣不通腹痛；熱侵心經，熱瘀交結則痛；心火下移到小腸，尿液會發紅、澀澀、灼熱；熱邪局限於肌表，皮膚脈絡氣血受阻則皮膚灼熱疼痛；熱入經絡關節，與氣血相爭，導致經絡關節郁結，四肢疼痛；邪熱盛則熱及肌肉，燒傷灼傷氣血，則生瘡、癤子、腫痛、灼痛，如肺癰、皮膚癤子等。
4.
濕邪壓制:濕為陰邪，重濁粘稠，最易壓制行氣，阻滯氣血，引起疼痛。濕能清竅，清陽，氣血運行不暢，脈絡受阻，頭痛如裹；濕邪困脾，使氣機升降失常，則腹脹疼痛，腹瀉；濕邪停留在靜脈，阻塞氣血，導致關節痛和劇烈疼痛。
5.
濕熱蘊蒸:濕熱結合，如油觸面，濕則愈熱愈深，熱則愈熱。濕熱最容易阻滯行氣，幹擾下註，遊走經絡，抑制氣血，使氣血運行不暢而成各種疼痛。濕熱蒸騰於上身，循經上行清竅，使氣血受阻清竅而不工作，故頭、耳、舌、口、喉諸竅疼痛；濕熱犯於上焦，抑制胸陽，阻滯心脈，使胸陽不展，阻滯心血，以致胸痛心痛；濕熱蘊於中焦或郁於肝膽，會引起脅痛、黃疸。或脾胃郁結，氣滯腑塞，則腹痛；濕熱之邪積於結腸，氣機不暢，傳導異常，則腹痛泄瀉；濕熱入下焦，或入膀胱，不利膀胱氣化，尿道絡脈不暢，致小便不利，尿急；或賭沖任，沖任之氣不利，乃腹痛所降；或者賭大腸，是痔瘡和肛裂。
此外，其他疾病，如痰飲、食積、蟲石滯留體內，或跌仆傷、瘀血於脈，也會影響氣血運行，從而出現各種疼痛綜合征。
(二)“失節致痛”是虛證病機的關鍵。
“失節致痛”是指邪氣入侵或臟腑功能低下，導致陰陽氣血失和，人體器官失去溫補、潤澤的脈絡而產生的疼痛癥狀。
1.陽氣不足，失去溫脈:陽氣不足，氣血運行無力，或脈脈不通，氣血凝滯，可引起疼痛；或者不能溫通臟腑經絡，經絡收縮導致疼痛。
2.陰血不足，脈絡失通:“血主流動”，血虛不能滋養潤澤臟腑、身體、九竅等組織器官，筋脈失養，脈絡緊張疼痛。
(3)疼痛綜合征的治療應以調神為先。
我們認為，疼痛雖然是由瘀血引起的，但並不與心分離，所以要調神導氣，以緩解疼痛。《靈樞·本心》雲:“所以讓物者謂之心。”所有的感覺都是心臟感覺刺激傳導後的反應，所以疼痛也是心臟感覺反應的發病機制傳導到心臟的感覺。《蘇文至真大論》雲:“壹切苦毒皆屬心”；“燥心甚痛，無聲心微痛”；“痛苦是上帝的回報。”要抑制疼痛反應，“心”需要感受到病變——氣血運行紊亂。因此，阻斷和轉移頭腦對疼痛病變的感知，使疼痛消失，也是針灸治療疼痛的機制之壹。也就是說，疼痛是上帝的生理和病理表現。疼痛雖然是因為氣血運行停滯，經絡不通，但是它的氣血運行還是要靠心態的調節。精神出用，精神不導氣，氣滯則血瘀疼痛。所以治療首先要調神，使氣易，用意疏通經絡，使氣通暢，使血管和諧，總的原則是無痛。臨床上常以耳穴水溝、內關、神門作為治療各種疼痛的基本方，強調調神、以神導氣、理氣止疼。根據疼痛的性質和部位，以辨證取穴為主，循經取穴為輔，以調神為主，疏通經絡為輔，起到調神導氣、止疼除痛的作用，用於治療各種疼痛證。
(四)疼痛綜合征的治療以疏通經絡為輔。
疼痛的機理在於不通，所以要疏通經絡止痛。“但是，溝通的方法不壹樣，以血調氣，以慈和溝通調血。上逆之者，使之下，中者，使之可及。虛者助其通，寒者暖之，無非是通之法。”(淩歡《醫學新傳》)說明“通”不僅僅是疏通下半身、破瘀散結的方法，其靈活妙用可謂層出不窮。皮膚堵塞的話要輕促，經常用發汗透邪的產品。根據寒熱性質不同，用桂枝湯、銀翹散加減。若腑氣不通，則降之，與承氣湯、大柴胡湯加減。過不去者，引之，用瓜迪散驗吐。這種方法現在已經很少使用了；那些過不去，導致精疲力盡，脈實有證，水滿尿滿，用八正散，五苓散治療。飽食者分食滯、氣阻、枳未熟致郁兩部分。血分不清就化解，常用桃核承氣、抵當湯丸之類；因其衰微，不近者，常選擇補中益氣湯、升息湯，即所謂虛有助於使之通。
針灸治療疼痛綜合征是有效的，針對不同的疼痛綜合征應采用不同的穴位和方劑，應用不同的針灸方法。《靈樞九針十二緣起》說:“欲以微針疏通其經脈，調理其血氣，使其出入會。”說明針刺具有疏通經絡、調理氣血的作用，適用於經絡阻滯、氣血不通所致的疼痛證。臨床治療疼痛綜合征時，常采用辨證取穴與循經取穴相結合的方法。辨證取穴是根據疼痛的病因和性質，這種方法多是治本；根據癥狀和經絡取穴是根據疼痛癥狀的部位，根據經絡經過、適應癥和取穴公式。這種方法主要是治標。
此外，根據《內經》“以痛為主”的原則，在臨床上也可沿經絡探尋壓痛點，治療打仆、扭傷、痹證等疼痛，往往收到良好的效果。