浙江海洋大學依托浙江省“海洋生物醫藥”重點學科，近五年來共主持和承擔國家自然科學基金10余項、國家重大科技合作項目1項、省部級科研項目50余項，獲得海洋科學技術獎壹等獎、二等獎、三等獎、浙江省科學技術獎二等獎、中國商業聯合會科學技術獎特等獎。主要研究方向有:
①海洋天然藥物
本方向以海洋中豐富的活性蛋白、寡肽、多糖和海洋脂類(魚油)，特別是結構獨特、活性顯著的次生代謝產物為基礎，開展海洋藥物和醫藥產品開發的應用基礎理論研究和關鍵技術研究，重點解決高活性、大規模海洋代謝產物即海洋藥物的快速發現、結構修飾、療效評價和產品開發中的關鍵技術。
②藥理學
本方向根據海洋活性物質的生物活性特點，運用動物學、細胞學、分子生物學和醫學科學的理論方法及相關前沿技術，篩選出具有抗腫瘤、抗心腦血管疾病、抗氧化、抗血栓形成等生物活性的藥物先導化合物。從海洋中藥、海洋次生代謝產物和化學合成化合物入手，探討其作用機制，闡明海洋藥物的藥理作用和成藥機制，為海洋新藥的開發提供科學的實驗依據。
③藥物化學
該方向將藥物設計與有機合成的新技術、新方法有機結合，以海洋活性天然產物的骨架結構為基礎，設計、發現和構建結構新穎、生物活性良好的化合物。通過探索新的藥物合成方法，優化藥物合成工藝，降低生產成本，提高藥物質量。采用化學合成與活性追蹤相結合的方法，系統研究了東海海洋藥物資源的活性成分在醫學上的應用，以充分發揮海洋資源的優勢。
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