儲存期間應經常檢查易發黴的昆蟲。如發現受潮，應取出曬幹，蟲蛀部分應及時取出，裝入布袋和木箱，或紙袋和紙箱，密封於石灰罐中，存放於陰涼處。
2.鳥巢
幹燕窩可放入冰箱冷藏，優質幹燕窩應放在陰涼處，不要陽光直射，應存放在幹燥處，防止壓碎。燕窩最好保存不超過壹年。
3.蟲草
很容易被蟲蛀，發黴，變色。應先用紙袋或塑料袋包裝，再用木箱包裝，密封，置於陰涼幹燥處。包裝的時候放壹些牡丹皮的碎片，不容易被蟲子吃掉。
4.膠水(阿膠、鹿角膠、龜甲膠)
受熱潮濕容易變軟。可以用油紙包起來，埋在谷殼裏，防止軟化或碎裂。也可密封於雙層塑料袋中，存放於陰涼幹燥處。夏天最好存放在密封的生石灰罐裏。
5、鹿茸
鹿茸密封在幹燥處防潮防蛀，用辣椒保存，可保存三到五年的藥用效果。
6.西洋參
可將少量西洋參放入廣口玻璃瓶中，蓋緊，放入冰箱冷藏。如果量有點大，需要長時間保存，可以放在保鮮盒裏，放在冰櫃裏保存。
7.熊膽
瓶或小盒，放在石灰罐中防止粘連和發黴或放在陰涼幹燥處。
8.麝香
密封，置於陰涼幹燥處，避光、防潮、防蛀。最常見的保存方法是將它們晾幹，用幹凈的塑料袋或玻璃瓶密封，放入冰櫃中保存。
9、牛黃
用保鮮膜包好或放入幹燥的玻璃瓶中，置於陰涼幹燥處，避光、密封、防潮、防壓。
10，壁虎
易被蟲蛀、發黴、出油，用鐵盒或木箱嚴密包裝。把辣椒放在盒子裏攪拌，防止蟲子吃。應存放於陰涼幹燥處，少量藥材可存放於石灰罐中。